Мутантам, во главе с профессором Чарльзом Ксавьером, опять прийдётся вступить в битву с самой эволюцией в лице их воскресшего товарища по команде… Джин Грэй, возрожденная в облике Темного Феникса, представляет опасность не только для мутантов, но и для самой себя и для всей человеческой расы. А когда найдено возможное лекарство - которое может предотвратить генетические мутации - наступает время решающей битвы между Людьми Икс, Братством Магнето и человечеством...

Мутанты - причуда науки и каприз природы, они - дети атомного века, сверх люди, новое звено в цепи эволюции. Каждый из них был рождён в результате уникальной генетической мутации, наделившей их с детства необыкновенными способностями. Этих изгоев ненавидят и боятся, те кто не способен понять и принять их индивидуальность. Под руководством профессора Чарльза Ксавьера, телепата с мировым именем, одарённые ученики научились контролировать и управлять своими удивительными способностями в интересах человечества. Могущественный мутант Магнето, собрал команду единомышленников. Он не верит, что люди и мутанты когда-либо смогут мирно сосуществовать, и они разработали план, чтобы осуществить захват власти над миром…

Мутанты продолжают борьбу против общества. Их положение становится еще более отчаянным, когда они подвергаются мощной атаке неизвестного противника, обладающего экстраординарными способностями. Внезапное нападение снова становится причиной политического и общественного резонанса по поводу введения повсеместной регистрации мутантов и причиной образования движения против мутантов, возглавляемого Уильямом Страйкером. Сбежавший из пластиковой тюрьмы Магнето предлагает Людям Икс объединиться и сражаться вместе против их общего устрашающего врага Страйкера...